Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
9930111J21Rik1Q5SVP0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms