Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pfdn6Q03958 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms