Protein–RNA interactions for Protein: Q00196

Pou2f2, POU domain, class 2, transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f2Q00196 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou2f2Q00196 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou2f2Q00196 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou2f2Q00196 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou2f2Q00196 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou2f2Q00196 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou2f2Q00196 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou2f2Q00196 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou2f2Q00196 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou2f2Q00196 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou2f2Q00196 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou2f2Q00196 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms