Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VldlrP98156 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VldlrP98156 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VldlrP98156 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms