Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmklr1P97468 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmklr1P97468 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms