Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tpm3P21107 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tpm3P21107 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms