Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox4i1P19783 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox4i1P19783 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox4i1P19783 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox4i1P19783 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cox4i1P19783 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cox4i1P19783 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cox4i1P19783 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cox4i1P19783 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cox4i1P19783 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cox4i1P19783 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cox4i1P19783 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cox4i1P19783 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms