Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BckdkO55028 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BckdkO55028 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BckdkO55028 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BckdkO55028 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BckdkO55028 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BckdkO55028 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BckdkO55028 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BckdkO55028 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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