Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chil3O35744 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chil3O35744 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chil3O35744 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms