Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna3O08545 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna3O08545 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna3O08545 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna3O08545 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna3O08545 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna3O08545 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna3O08545 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efna3O08545 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.4 ms