Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbip1J3QMK2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms