Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20425E9Q035 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm20425E9Q035 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms