Protein–RNA interactions for Protein: D3YWW5

Rtl10, Retrotransposon Gag-like 10, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl10D3YWW5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl10D3YWW5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl10D3YWW5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl10D3YWW5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl10D3YWW5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rtl10D3YWW5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rtl10D3YWW5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rtl10D3YWW5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rtl10D3YWW5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rtl10D3YWW5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rtl10D3YWW5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rtl10D3YWW5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rtl10D3YWW5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl10D3YWW5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Rtl10D3YWW5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl10D3YWW5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rtl10D3YWW5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rtl10D3YWW5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rtl10D3YWW5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl10D3YWW5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl10D3YWW5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl10D3YWW5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rtl10D3YWW5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rtl10D3YWW5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rtl10D3YWW5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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