Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stx12Q9ER00 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms