Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan11Q9D1D1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan11Q9D1D1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms