Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx15Q91WE1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx15Q91WE1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms