Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mre11Q61216 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mre11Q61216 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms