Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uspl1Q3ULM6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uspl1Q3ULM6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uspl1Q3ULM6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uspl1Q3ULM6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uspl1Q3ULM6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uspl1Q3ULM6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uspl1Q3ULM6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uspl1Q3ULM6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uspl1Q3ULM6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uspl1Q3ULM6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uspl1Q3ULM6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uspl1Q3ULM6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uspl1Q3ULM6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uspl1Q3ULM6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uspl1Q3ULM6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uspl1Q3ULM6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Uspl1Q3ULM6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uspl1Q3ULM6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms