Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TchpQ3TVW5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms