Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn6Q03958 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn6Q03958 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn6Q03958 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn6Q03958 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn6Q03958 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn6Q03958 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn6Q03958 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn6Q03958 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn6Q03958 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn6Q03958 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn6Q03958 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfdn6Q03958 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms