Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cct3P80318 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cct3P80318 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cct3P80318 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cct3P80318 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cct3P80318 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cct3P80318 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cct3P80318 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cct3P80318 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cct3P80318 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cct3P80318 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cct3P80318 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cct3P80318 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cct3P80318 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cct3P80318 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cct3P80318 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cct3P80318 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cct3P80318 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Cct3P80318 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct3P80318 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct3P80318 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cct3P80318 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms