Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kif3aP28741 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Kif3aP28741 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.3 ms