Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb1bp2Q9R000 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1bp2Q9R000 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1bp2Q9R000 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1bp2Q9R000 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1bp2Q9R000 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1bp2Q9R000 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1bp2Q9R000 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1bp2Q9R000 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1bp2Q9R000 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1bp2Q9R000 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1bp2Q9R000 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1bp2Q9R000 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1bp2Q9R000 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb1bp2Q9R000 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms