Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Subh2bvQ9D9Z7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Subh2bvQ9D9Z7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms