Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt34Q9D646 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt34Q9D646 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms