Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9D3J9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D3J9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D3J9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D3J9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D3J9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms