Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lactb2Q99KR3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms