Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SrrdQ8K2M3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrrdQ8K2M3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms