Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc1Q80VQ1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc1Q80VQ1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc1Q80VQ1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrc1Q80VQ1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
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Lrrc1Q80VQ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms