Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nlrp9cQ66X01 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp9cQ66X01 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp9cQ66X01 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms