Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mdc1Q5PSV9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mdc1Q5PSV9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mdc1Q5PSV9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms