Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmod2Q3UHZ5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.6 ms