Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TchpQ3TVW5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TchpQ3TVW5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms