Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc10Q3TLI0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc10Q3TLI0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms