Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl9P51670 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl9P51670 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms