Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TfamP40630 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TfamP40630 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TfamP40630 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TfamP40630 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TfamP40630 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TfamP40630 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TfamP40630 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TfamP40630 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TfamP40630 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TfamP40630 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TfamP40630 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TfamP40630 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TfamP40630 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TfamP40630 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TfamP40630 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TfamP40630 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TfamP40630 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TfamP40630 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TfamP40630 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TfamP40630 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TfamP40630 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TfamP40630 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TfamP40630 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TfamP40630 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TfamP40630 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TfamP40630 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TfamP40630 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TfamP40630 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TfamP40630 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TfamP40630 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TfamP40630 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TfamP40630 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TfamP40630 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TfamP40630 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TfamP40630 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TfamP40630 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TfamP40630 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TfamP40630 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TfamP40630 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TfamP40630 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TfamP40630 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TfamP40630 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TfamP40630 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TfamP40630 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TfamP40630 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TfamP40630 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TfamP40630 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TfamP40630 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TfamP40630 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TfamP40630 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TfamP40630 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TfamP40630 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TfamP40630 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TfamP40630 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TfamP40630 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TfamP40630 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TfamP40630 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TfamP40630 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TfamP40630 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TfamP40630 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TfamP40630 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TfamP40630 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TfamP40630 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TfamP40630 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TfamP40630 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TfamP40630 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TfamP40630 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TfamP40630 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TfamP40630 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TfamP40630 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TfamP40630 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TfamP40630 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TfamP40630 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TfamP40630 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms