Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tpm3P21107 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpm3P21107 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms