Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NclP09405 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NclP09405 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NclP09405 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NclP09405 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NclP09405 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NclP09405 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NclP09405 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NclP09405 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NclP09405 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NclP09405 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NclP09405 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NclP09405 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NclP09405 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NclP09405 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NclP09405 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NclP09405 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NclP09405 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NclP09405 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NclP09405 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NclP09405 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NclP09405 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NclP09405 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NclP09405 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NclP09405 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NclP09405 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NclP09405 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NclP09405 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NclP09405 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NclP09405 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NclP09405 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NclP09405 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NclP09405 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NclP09405 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NclP09405 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NclP09405 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NclP09405 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NclP09405 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NclP09405 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NclP09405 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NclP09405 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NclP09405 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NclP09405 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NclP09405 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NclP09405 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NclP09405 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NclP09405 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NclP09405 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NclP09405 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NclP09405 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NclP09405 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NclP09405 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NclP09405 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NclP09405 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NclP09405 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NclP09405 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NclP09405 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NclP09405 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NclP09405 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NclP09405 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NclP09405 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NclP09405 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NclP09405 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NclP09405 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NclP09405 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NclP09405 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NclP09405 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NclP09405 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NclP09405 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NclP09405 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NclP09405 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NclP09405 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NclP09405 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NclP09405 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NclP09405 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NclP09405 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NclP09405 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NclP09405 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NclP09405 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NclP09405 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NclP09405 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms