Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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BckdkO55028 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BckdkO55028 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BckdkO55028 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BckdkO55028 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BckdkO55028 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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BckdkO55028 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BckdkO55028 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
BckdkO55028 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BckdkO55028 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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BckdkO55028 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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BckdkO55028 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdkO55028 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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BckdkO55028 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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BckdkO55028 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdkO55028 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdkO55028 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdkO55028 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdkO55028 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdkO55028 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdkO55028 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdkO55028 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdkO55028 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdkO55028 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdkO55028 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdkO55028 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdkO55028 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BckdkO55028 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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BckdkO55028 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms