Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mfsd4b4J3QNS5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mfsd4b4J3QNS5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms