Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbip1J3QMK2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbip1J3QMK2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms