Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8247F6VRJ8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8247F6VRJ8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8247F6VRJ8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8247F6VRJ8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8247F6VRJ8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8247F6VRJ8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8247F6VRJ8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8247F6VRJ8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8247F6VRJ8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8247F6VRJ8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8247F6VRJ8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8247F6VRJ8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8247F6VRJ8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8247F6VRJ8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8247F6VRJ8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8247F6VRJ8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm8247F6VRJ8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8247F6VRJ8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms