Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cacna1iE9Q7P2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cacna1iE9Q7P2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms