Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trappc8E9PWG2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trappc8E9PWG2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trappc8E9PWG2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms