Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cited4Q9WUL8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cited4Q9WUL8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms