Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six6Q9QZ28 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms