Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Hmgn5Q9JL35 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Hmgn5Q9JL35 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Hmgn5Q9JL35 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hmgn5Q9JL35 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hmgn5Q9JL35 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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