Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Smim3Q99PE5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 815.2 ms