Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lactb2Q99KR3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lactb2Q99KR3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms