Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf9Q8K342 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf9Q8K342 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms